复杂系统(Complex Systems)，或称复杂性 (Complexity)，主要研究复杂系统由微观层次上各子系统之间的相互作用所导致的宏观层次上的系统结构与行为。它涉及到自然科学、工程学、经济学、管理学和人文与社会科学等各个领域，可概括为自然界演化过程中形成的复杂系统、社会经济复杂系统、工程和过程复杂系统。复杂系统的研究是现代社会和高技术发展的需求，也是基础研究所面临的重大科学挑战，可能会给人类社会的各个领域带来深远的影响。
中科院数学与系统科学研究院复杂系统研究中心成立于2003年1月，致力于复杂系统的建模、仿真与干预的研究，力图发现复杂现象背后的本质性科学规律，寻找复杂系统干预与控制的普适原理及有效方法。中心将利用研究院在系统科学、控制理论、计算机科学、人工智能、统计与计算科学、运筹管理、以及现代数学等研究方向上的总和优势，同时与国际复杂系统研究的著名机构圣菲研究所、国内的上海系统科学研究院等研究机构密切合作交流。本中心每周举行一次讨论班和不定期举行研讨会，努力促进科研人员之间，学科之间的交流。
研究中心目前的研究方向如下：
子控制系统
复杂多个体系统
复杂网络
复杂系统控制
我们欢迎有志于复杂系统研究的优秀人才加入，共同推动复杂性研究的进展！